【宏基因组云平台使用说明书-美吉生物(20页)】一、前言

随着高通量测序技术的迅猛发展，宏基因组学已成为研究微生物群落结构与功能的重要手段。为了更好地支持科研人员在宏基因组数据分析中的高效工作，美吉生物推出了“宏基因组云平台”，旨在为用户提供一站式、智能化的基因组数据处理与分析服务。

本使用说明书旨在帮助用户全面了解并熟练操作宏基因组云平台的各项功能模块，从而提升数据分析效率和成果质量。通过本手册，您将掌握从样本上传、数据预处理、物种分类、功能注释到结果可视化等全流程操作流程。

二、平台简介

1. 平台定位

宏基因组云平台是基于云计算技术构建的专业化数据分析平台，集成了多种主流的宏基因组分析工具与算法模型，支持对来自不同来源（如肠道、土壤、水体等）的宏基因组数据进行系统性分析。

2. 主要功能模块

- 数据上传与管理

- 质控与预处理

- 物种组成分析

- 功能注释与代谢通路分析

- 差异比较与统计分析

- 可视化展示与报告生成

3. 使用对象

本平台适用于高校、科研机构、生物医药企业等从事微生物组学研究的相关人员，也适合需要进行宏基因组数据解读的技术支持团队。

三、平台访问与注册

1. 登录方式

用户可通过以下方式访问平台：

- 官方网站：[www.meglab.com](http://www.meglab.com)

- 企业内部部署版（需联系技术支持）

2. 注册与登录

首次使用需完成注册流程，填写基本信息并绑定邮箱或手机号。注册成功后，可使用账号密码登录平台。

3. 权限管理

平台支持多角色权限设置，包括管理员、项目负责人、普通用户等，便于团队协作与数据管理。

四、数据上传与管理

1. 数据格式要求

平台支持常见的FASTQ格式文件（单端/双端），建议使用压缩包形式上传以提高效率。

2. 上传流程

- 登录后进入“数据管理”页面

- 点击“新建任务”

- 选择数据类型及上传方式（FTP / Web）

- 上传完成后进行校验与确认

3. 数据存储与备份

平台提供数据加密存储与定期备份机制，确保数据安全与长期可用性。

五、数据分析流程

1. 质控与预处理

- 自动执行QC检查（如GC含量、长度分布、接头污染等）

- 提供可视化图表辅助判断数据质量

- 支持手动调整参数进行优化处理

2. 物种分类分析

- 基于参考数据库（如Silva、Greengenes）进行OTU聚类

- 可视化展示门、纲、目、科、属、种级别的分类结果

- 支持与标准菌株数据库比对，识别潜在病原体或功能菌群

3. 功能注释与代谢通路分析

- 利用KEGG、COG、Pfam等数据库进行功能注释

- 展示关键代谢通路与基因功能富集分析

- 支持自定义功能标签进行定向分析

4. 差异比较与统计分析

- 提供组间差异显著性分析（如LEfSe、ANOSIM）

- 支持多组对比与热图展示

- 自动生成统计报告与可视化图表

六、结果可视化与报告生成

1. 图表展示

平台内置多种可视化工具，支持：

- 物种丰度柱状图、饼图

- PCA、NMDS等非度量多维尺度分析图

- 热图、散点图、折线图等

2. 报告生成

- 用户可一键生成标准化分析报告

- 支持PDF、Word、HTML等多种格式导出

- 报告内容包括数据概述、分析过程、图表展示与结论总结

七、常见问题与支持

1. 常见问题解答

- 如何解决上传失败？

- 如何查看历史任务记录？

- 如何获取帮助文档？

2. 技术支持

- 在线客服：7×24小时在线响应

- 邮件支持：support@meglab.com

- 定期举办线上培训与答疑会

八、附录

1. 数据库更新说明

- 平台定期更新参考数据库，确保分析结果的准确性与前沿性。

- 更新日志可在“系统设置”中查看。

2. 接口文档（API）

- 适用于开发者或集成需求的用户，提供RESTful API接口文档。

3. 版本信息

- 当前版本：V2.3.1

- 更新日期：2025年4月

九、结语

宏基因组云平台作为美吉生物在基因组学领域的又一重要产品，致力于为用户提供高效、精准、便捷的数据分析体验。我们希望本手册能够帮助您快速上手并充分发挥平台的功能价值，助力您的科研工作更上一层楼。

如您在使用过程中有任何疑问或建议，欢迎随时联系我们，我们将竭诚为您服务。

美吉生物——让基因组数据更有价值